Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc12Q8R344 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms