Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vrk3Q8K3G5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vrk3Q8K3G5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vrk3Q8K3G5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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