Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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