Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Matr3Q8K310 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Matr3Q8K310 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms