Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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