Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkn3Q8K045 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms