Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx16Q8C080 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx16Q8C080 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx16Q8C080 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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