Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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