Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gpc2Q8BKV1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gpc2Q8BKV1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gpc2Q8BKV1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gpc2Q8BKV1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gpc2Q8BKV1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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