Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms