Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH27

Megf9, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf9Q8BH27 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Megf9Q8BH27 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms