Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms