Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI1

Trnp1, TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1Q80ZI1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trnp1Q80ZI1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trnp1Q80ZI1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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