Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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