Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms