Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NischQ80TM9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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