Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms