Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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