Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme8Q715T0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms