Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp12Q6P5B0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp12Q6P5B0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms