Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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