Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms