Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim24Q64127 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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