Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hes3Q61657 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms