Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ift88Q61371 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift88Q61371 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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