Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms