Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms