Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vmo1Q5SXG7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms