Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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