Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp48Q3V0C5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms