Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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