Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms