Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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