Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D13Ertd608eQ3UPR8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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