Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms