Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3UJP5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3UJP5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3UJP5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms