Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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