Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms