Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samd11Q1RNF8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Samd11Q1RNF8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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