Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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