Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc162pQ0VG85 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc162pQ0VG85 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc162pQ0VG85 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc162pQ0VG85 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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