Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms