Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms