Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cib3Q0P523 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms