Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms