Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms