Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms