Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms