Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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