Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Siah2Q06986 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms